De coördinatie Projecten- en Portfoliobeheer (PPMO) ondersteunde een aantal projecten die door het directiecomité waren geselecteerd en verschillende doelstellingen hadden.
Het belangrijkste doel van deze projecten was voldoen aan wettelijke verplichtingen. Veel projecten bereidden ons agentschap voor op de nieuwe Europese wetgeving zoals Verordening (EU) 2019/6 voor diergeneesmiddelen, Verordening (EU) 2017/745 voor medische hulpmiddelen en Verordening (EU) 2017/746 voor medische hulpmiddelen voor in-vitrodiagnostiek.
Andere projecten zijn louter op initiatief van ons agentschap opgestart met als doel de dienstverlening aan het publiek verbeteren. Een voorbeeld hiervan is het platform FarmaStatus dat de burger informeert over de beschikbaarheid van geneesmiddelen in België. Via het platform kunnen actoren van de geneesmiddelenmarkt (van de producent tot de apotheker) het agentschap informeren over de beschikbaarheid van geneesmiddelen. In 2021 werd ook een project opgezet waarbij patiënten of gezondheidszorgbeoefenaars bijwerkingen konden melden tijdens COVID-19-vaccinatiecampagnes. Er lopen ook verschillende projecten rond de evolutie van technologie en betere informatisering van onze activiteiten. Het is moeilijk om de PPMO-projecten volgens deze doelstellingen in te delen, aangezien de meeste ervan aan verschillende doelstellingen beantwoorden.